无论是传统的水产养殖模式，还是新型的工厂化水产养殖模式，一些基本的水质参数都是需要达标的。比如养殖水体的温度、溶氧量、氨氮含量、亚盐含量等。在实际应用中不同的鱼种对这些参数的要求和耐受力也是不同的。在高密度工厂化水产养殖条件下，时刻保证相应的水质参数达标是整个循环水处理系统配置的根本依据。工厂化水产养殖系统的基本组成及工艺流程 工厂化水产养殖系统的配置应与对应鱼种的适应环境相匹配。以全封闭的循环水养殖系统为例。
生物絮团技术是指通过操控水体营养结构，向水体中添加有机碳物质，调节水体中的C/N比，促进水体中异养细菌的繁殖，利用微生物同化无机氮，将水体中的氨氮等养殖代谢产物转化成细菌自身成分。并且通过细菌絮凝成颗粒物质被养殖动物所摄食，起到维持水环境稳定、减少换水量、提升动物免疫力、提高养殖成活率、增加产量和降低饲料系数等作用的一项技术，它被认为是解决水产养殖产业发展所面临的环境制约和饲料成本的有效替代技术。
水霉病对水产动物没有选择性，凡是受伤的都有被感染的可能，水霉菌是腐生性的，它不感染健康无伤的鱼。因为活细胞具有“抗霉s”，“抗霉s”很可能存在于黏液分泌细胞所分泌的黏液中，细胞一死，就停止分泌黏液，水霉菌孢子很快寄生上去。疾病早期基本没有症状，当肉眼能发现症状时候，菌丝已经在伤口侵入并向外长出外菌丝，似灰白色的绵毛状，俗称“生毛”或白毛病。霉菌可以分泌大量的蛋白酶，机体受刺激后能分泌大量的粘液。