在水产养殖中，底改顾名思义应该就是改良池塘底部理化条件的意思，让池塘底部的理化条件能够在适合养殖对象的生存，而这些良好池塘底部理化条件又决定了池塘底部的微生态圈，从而又决定了池塘有相对高溶解氧、有氧的代谢氨氮和亚*酸盐等氮循化，起到维护水体生物稳定性的营养库作用。底改就是为了池塘底部保持合适的（不太多也不太少）有机物含量，以发挥池塘营养库作用提高池塘生产力同时耗氧量不会太高。也就是说：避免底泥太瘦水体藻生长不稳定，同时避免底泥太肥耗氧量太高而水质恶化。很多水产养殖户对于改底也没有太多的办法，主要是通过撒生石灰对底部消毒这种传统办法改底，这样是远远不够的。
在分解细菌的作用下，再进一步转化成了氨。被鱼类吃掉的一部分经过鱼类的消化，也转变成氨。殊途同归的氨在分子态时是一种剧毒物质。在硝化细菌的作用下，它会被转化成亚盐。亚盐是一种不太稳定的物质。在高氧化还原电位的情况下，会被氧化成亚盐。此时如果有反硝化细菌，盐就会被转化成N2从水中溢出。这样，水体中的氮元素就完成了一个完整的转化分离过程。 在实践中，生物过滤的细菌需要适宜的条件才能起到相应的作用。如水体的温度、PH、溶氧量、合适的碳氧化、杀菌剂等。因此，不仅要求其他系统设备与生物过滤器配套，更对操作者有一定的技术要求。
广州环控农业生物科技有限公司针对如何防止水产养殖疾病的滋生做出了长时间研究，经过几年时间的不断反复研究，发现病毒的滋生主要是因为养殖水体质量变差恶化造成的，很多的病毒在养殖水体质量差的环境中会显得异常活跃。同时广州环控经过几年时间的研究发现，水产养殖户们所做的防护措施根本是治标不治本的，可能短时间内有效，因为他们根本没有一整套完整的系统去维持水体环境质量。