工厂化循环水从水处理的侧重点不同分为机械模式和生化模式，主要区别就是看能耗大小，本文所讲的是生化模式。这个模式能否成功，与虹吸能否顺利运行有直接关系，虹吸设备需要时常维护否则会莫名其妙的失效。有人说：我都准备投入了30万，你告我天天还得维护，这是搞毛线啊？虹吸失败的话，整个系统视养殖密度在两天到四天以内崩溃----鱼虾死光光。工厂化循环水系统的重点是净水系统，占比50%；生物习性占30%；其他的溶氧恒温等条件的占比20%。
每平方米放苗250～400尾，暂养后的大虾苗放养密度可减少20%～30％；实行三级养殖时**级每平方米可放养虾苗1000～1200尾，二级每平方米放养500～800尾，三级每平方米放养250～300尾。在低盐度或淡水中养殖凡纳滨对虾时，必须对虾苗进行淡水驯化。在育苗室淡化速度每日盐度降低不超过5，降至5时便可直接向微盐池塘中放苗。在淡水池养殖，应选择在盐度1以下水中稳定培育3天以上的虾苗，亦可先向池塘内加入20～30厘米的淡水，再用出盐前的卤水或海水素（精）调节至适宜的盐度放养虾苗，经数日暂养后，再逐日加入淡水。
构建的工厂化循环水养鱼系统，主要通过优化集成一批节本、节能型养殖设施及水处理技术，包括单元式养殖池、生物移动床、截留沉淀、气提泵等，在保证系统水处理效果及生产能力的同时，有效降低了系统运行能耗。以同等养殖密度为40kg-50kg/m3，每日换水量为5%-10%/天计算，系统整体运行能耗相对于常规典型的循环水养殖系统可降低30%左右，比较符合我国可持续发展与健康养殖要求的，是一种具有良好推广应用前景的工厂化循环水养殖模式。