目前我国平均每立方米的产量为7.4 公斤（淡水为8.2公斤、海水为6.4公斤），全国范围循环水养殖发展力不足的特征仍较明显。目前工厂化养殖的方式大体上分为流水养殖、半封闭循环水养殖和全封闭循环水养殖等三种形式。受水处理成本的压力，仍主要以流水养殖、半封闭循环水养殖为主，真正意义上的全工厂化循环水养殖工厂比例极少。我国工厂化循环水养殖发展中存在的问题，主要还是受限于经济实力、产品市场、养殖品种、养殖规模、经济效益比等因素，主观上还受限于养殖者对养殖技术的掌握和对先进技术的利用。
近些年来，随着水产养殖塘租、鱼种、药费、刮鱼人工等费用的增加，使得养殖成本的大大提高，很多水产养殖户为了降低成本，便开始加大放养密度。高密度养殖能够带来更高收益的同时也带来难以解决的危害，很多水产养殖户都不同程度上出现了养殖池亚*酸盐过高的现象。养殖池亚*酸盐过高会引发一系列问题，例如：造成鱼黑鳃、鳃肿、烂鳃，严重时大量死鱼；增氧不够或天气差时，鱼容易缺氧浮头；导致鱼吃料变差，且容易出现肠炎；刮鱼时容易出现“白身”、“烧尾”、“硬骨”等问题。而高密度养殖会增加处理亚*酸盐的难度，很多养殖户连泼2-3次降亚*酸盐药都不见效果。
突破海水工厂化循环水养殖的技术难点 集成国内外先进水处理技术，创新海水养殖水处理新模式、新技术，开发“经济(造价低)、实用(满足生产功能要求)、好用(生产管理方便)”，能够满足不同用户、不同养殖对象生产需求的设施设备。研究工厂化循环水养殖的关键生产技术 高密度养殖条件下，密度胁迫作用会引起动物机体产生一系列生理变化，研究养殖对象在高密度环境下的适应机制，掌握养殖和育苗生产中的适当放养密度。