水体的盐度和硬度都能达到饱和进而析出，所以必须在系统内部放置植物。可以在水体内放置水葫芦、空心菜、浮萍等，也可以在硝化池种蔬菜比如西红柿树、地瓜树、西瓜、土豆，矮化的果树也是可以的。在水池内放置水葫芦则需要注意不能被鱼吃掉了。这样植物还会遮光，避免鱼被日光照射，同时还能收获大量蔬菜和鱼食。整个系统是需要日光的，一来是植物光合作用消耗肥水无机盐，再就是给水体加温，应尽可能的加大日光采集。
在使用循环水养殖系统后，企业能耗费用明显降低，养殖池水经过处理后循环使用，降低了企业取水成本，水质明显提高，鱼虾发生病害几率迅速降低，每年可为企业节约费用达几十万元。工厂化循环水养殖模式具有节水、节地、生态环保、生产可控性强、高密度、低风险、水产品质量安全等优点，被认为是代表21世纪水产养殖业发展的主导方向之一。我国作为世界水产养殖大国，推广工厂化循环水养殖模式。推进水产养殖技术向高端、精准、节能、高产的方向发展。
循环水养殖系统难点是解决氮循环的问题，要消除氨氮和亚硝/酸氮的影响。传统的解决方案是在循环水养殖系统中加入了反硝化反应池，但由于反硝化作用需要在严格厌氧条件下进行，因此硝化作用反应池需要跟反硝化作用反应池分开，这就增加了循环水养殖系统的成本。前循环水养殖设备已实现工厂化生产，实现养殖池与养殖净化设备的无缝连接。通过一系列的物理过滤、化学沉淀以及通过微生物的作用去除氨氮、硝氮和亚硝氮再通过杀菌消毒、充氧等操作，水体重新流回到循环水养殖系统中，实现养殖水的循环利用。