循环水养殖系统原理：从第1个1400平米养殖车间的水源经过蛋白分离（泡沫分离器）、沉淀池沉淀后将水源流向下一个1400平米养殖车间继续使用，达到养殖水源两次利用，循环用水50%，大大节约了地下海水。技术流程：出水→微滤机过滤→臭氧消毒→蛋白质分离器→生物过滤→紫外杀菌→纯氧充氧→监测→进池。监测系统：监测pH、DO、T、氧化还原电位，带有报警系统。日换水量控制在总水量的10%—15%（即50—80 m3）之间。温控系统采用地下井水交换来控制。充的纯氧来自液氧罐。
广州环控农业生物科技有限公司针对改底这一种现象进行了大量的研究和试验，发现流动的水体有助于池底的改善，再配合科学的喂养方式以及定期的池底清洁，能够很好改善底部质量，从而改善水体质量。这种科学的养殖系统称为循环水养殖系统，循环水养殖系统由多种循环水养殖设备构成，这一整套循环水养殖设备就是改善养殖水体质量的主要工具，适用于各种水产品种养殖。
目前我国平均每立方米的产量为7.4 公斤（淡水为8.2公斤、海水为6.4公斤），全国范围循环水养殖发展力不足的特征仍较明显。目前工厂化养殖的方式大体上分为流水养殖、半封闭循环水养殖和全封闭循环水养殖等三种形式。受水处理成本的压力，仍主要以流水养殖、半封闭循环水养殖为主，真正意义上的全工厂化循环水养殖工厂比例极少。我国工厂化循环水养殖发展中存在的问题，主要还是受限于经济实力、产品市场、养殖品种、养殖规模、经济效益比等因素，主观上还受限于养殖者对养殖技术的掌握和对先进技术的利用。