生化过滤依靠的是硝化细菌，硝化细菌的数量直接影响净水效能。硝化细菌的数量和滤材的表面积有关：表面积越大就能附着越多的硝化细菌。有资料显示，火山石的比表面积是300平方米/立方，K1是500平方米/立方。还有一种micro k1的东西，国内电商平台上面没有见过，比表面积是950平方米/立方。常见的过滤还有沼泽过滤，这个属于是被动过滤，滤材上的硝化细菌因为得不到足够的氧气，硝化反应比较慢，大多数商超暂养用的就是这种过滤，优点是建造完成后基本无需维护。
在水产养殖中，底改顾名思义应该就是改良池塘底部理化条件的意思，让池塘底部的理化条件能够在适合养殖对象的生存，而这些良好池塘底部理化条件又决定了池塘底部的微生态圈，从而又决定了池塘有相对高溶解氧、有氧的代谢氨氮和亚*酸盐等氮循化，起到维护水体生物稳定性的营养库作用。底改就是为了池塘底部保持合适的（不太多也不太少）有机物含量，以发挥池塘营养库作用提高池塘生产力同时耗氧量不会太高。也就是说：避免底泥太瘦水体藻生长不稳定，同时避免底泥太肥耗氧量太高而水质恶化。很多水产养殖户对于改底也没有太多的办法，主要是通过撒生石灰对底部消毒这种传统办法改底，这样是远远不够的。
项目投产前，首先需要决定养殖品种：因为底息类的鱼池设计有区别，同时还需要对生物习性了解清楚：喜欢静水，还是喜欢顶水；适宜水温等等条件，不一而足。再了解了生物习性后，工厂化循环水养鱼成功与否取决于以下几个主要条件：溶氧量、水质、水温，如果是海鱼的话还有盐度。副条件还有：ph、硬度、盐度(淡水鱼)、光照等。买鱼苗后先进行观察筛选（15天以上），把那些状态不好的，比如明显有寄生虫、残疾等不适合的剔除了，省的以后麻烦。在观察期间还会死鱼，除了体质问题外，还有一个因素是水体各元素含量不同导致的。