循环水养殖系统难点是解决氮循环的问题，要消除氨氮和亚硝(xiao)酸氮的影响。环控公司的解决方案是在循环水养殖系统中加入了反硝化反应池，但由于反硝化作用需要在严格厌氧条件下进行，因此硝化作用反应池需要跟反硝化作用反应池分开。目前循环水养殖设备已实现工厂化生产，做到了养殖池与养殖净化设备的无缝连接。通过一系列的物理过滤、化学沉淀以及通过微生物的作用去除氨氮、硝氮和亚硝氮再通过杀菌消毒、充氧等操作，水体重新流回到循环水养殖系统中，实现养殖水的循环利用。
既然是养活物，非常核心的两个问题，一个是用什么养？即养殖模式，一个是怎么养？养殖管理。养殖模式包括养殖技术和手段。而养殖管理谈的是如何统筹、调动人、物、水，让人尽其能，物尽其用，水尽其利。养殖技术没什么好说的，养殖业发展至今，技术必然已经足够成熟到可以支撑这个产业，而手段（循环水养殖）刚才也已经说过了。但有一点是被大多数人有意或无意忽略了的问题，就是养殖管理。
循环水养殖系统一种新型的养殖模式，也叫工厂化循环水养殖系统、室内循环水养殖系统。是一种通过水处理设备将养殖水净化处理后再循环利用的一种养殖模式。工厂化循环水养殖系统融入了生物学、工程学、流体力学、环境工程学、信息学等多种学科的知识，是一个多学科，多领域技术交叉，具有较强技术含量的系统。工厂化循环水养殖系统是以工业化手段主动控制水环境。