生化模式净水主要是靠硝化细菌，硝化细菌从无到有这个过程俗称挂膜。硝化细菌挂膜需要滤材（细菌屋）；硝化细菌属于好氧细菌，因此需要氧气；硝化细菌繁殖还需要养分，也就是鱼粪。再满足上诉三个情况下，保持25度水温，硝化细菌从无到有需要将近35天，15度水温情况下需要50天或者更久，这个过程叫冷启动。想快速启动，可以使用液体硝化细菌，或者添加一些其他已经挂膜的滤材进来进行引菌，这个过程叫热启动。海水系统应为高盐度的问题，自然挂膜时间比淡水系统要长一倍以上，时间也随盐度升高而延长。
我们应该用目标产量和预算来衡量需要做多大面积的工厂化循环水养殖系统，而不是简单的用面积来做对比。 工厂化循环水养殖系统前期投入相对较高，如果简单套用原来池塘养殖的经验和面积，总投资额会是一个很庞大的数字，普通养殖户难以接受，也无形中放大了工厂化循环水养殖的高投入印象，不利于养殖户对工厂化养殖产生合理的理解。 在从传统池塘养殖转换到工厂化循环水养殖的过程中，我们可以用一个简单的比例来进行换算，同样的产量，工厂化循环水养殖仅需池塘养殖面积的10%。有了这个比例，就能更科学的规划养殖面积和预算。
造成“白便”疾病发生的原因大概可概括为三点：1、前期大量投喂高蛋白饲料或长期投喂劣质饲料；2、大量的鞭毛藻类（主要隐藻、裸甲藻和夜光藻），造成水体分层、pH值过高（普遍在9.0左右或以上）、毒素逐步积累以及对虾的采食造成消化不良；3、弧菌感染。知道病因就要做出相应的防护措施：1、稳定水质，保持水质清爽，培养优质藻类，主要藻类以：小型绿藻和硅藻为主；切记避免鞭毛藻为主的水质；2、定期做好弧菌预防工作，特别在连续高温、暴雨过后和进水；3、定期做好内服保养工作，以提高对虾消化免疫系统、增强抗病力和自我修复能力。