养殖过程中产生的残饵、粪便，有部分无法通过换水排出而吸附在池壁池底。洗池对于排出养殖池底的污物有一定效果。无死角的养殖池形状结合向中央倾斜的池底和中央排污方式，可以有效的排出池底污物。当同一个养鱼池中鱼的大小、强弱不一时，会严重影响鱼的生长速度，因而，养殖过程中必须按时进行大小分选。鱼的大小分选不仅可以防止互残（半滑舌鳎的互残的情况很少发生），而且便于进行管理，尤其是幼鱼，幼鱼生长比较快，分选和不分选，幼鱼的生长、死亡率和饵料的利用率相差很大。但要尽可能减少分养次数，过多次数的分养会使鱼体受伤，增加鱼的应激反应。
这套系统叫做循环水养殖系统，也可以形象地理解为“工厂化养殖”，是目前先进的水产生态养殖技术。在总产不降的情况下，从原有的养殖水面辟出一块进行集约化，解决了水源问题，使养殖水质比较稳定，对周边环境也比较友好。可增产增效、节地节水，破解了常规养殖面临的诸多可持续发展问题。工厂化循环水养殖是一种现代工业化生产方式，基本上不受自然条件的限制，可以根据需要在任何地点建立海水或淡水的养殖生产系统，达到生产过程程序化、机械化的要求。
很多人会问自来水可以进行水产养殖吗，答案是否定的。让我们来先了解一下鱼的免疫系统，鱼身体的表皮层内长有一种杯状细胞，不断地在分泌着粘液，使鱼体减少游在水中的摩擦，同时，粘液又能保护鱼体不受寄生物、霉菌、细菌和其他微小生物的侵蚀，并使皮肤具有一种正常的渗透能力。为什么说自来水不适合水产养殖呢，因为自来水中主要含有"氯"的成份。自来水中的氯却是一种强氧化剂，在水中生成很不稳定的强氧化剂---次氯酸。