20世纪90年代，在淡水养殖方面，随着经济的快速发展，全国各地兴建了很多水产养殖示范区，建立了一批淡水鱼类工厂化循环水养殖系统，但是其经济性矛盾依然突出。而工厂化循环水苗种繁殖生产系统具有水环境可控、苗种质量高等优点，适应了苗种生产的反季节性、水质条件要求高的特点，并且苗种的单位产值高，使之得到了一定程度的应用。以大菱鲆工厂化流水养殖为代表的海水工厂化养殖的大力推广，随之而来的是优质水资源大量耗用，尤其是地下水资源，造成地下水位下降、地陷等诸多问题。“九五”以来，国家有关科研计划大力支持海水工厂化循环水养殖的研究，并取得了重要的阶段性成果。
溶氧量充足可以改善鱼类栖息的生活环境，降低氨氮、亚硝(xiao)酸态氮、硫化氢等有毒物质的浓度。鱼虾生活在溶氧不足的水中，体质将下降，对疾病抵抗力降低，发病率升高，在低氧环境下寄生虫病也易于蔓延。由于国内现阶段池塘养殖方式较为广泛，工厂化养殖厂规模大多较小，所以主要使用机械式增氧机。工厂化养殖规模大，养殖密度高，对增氧系统要求高，普遍采用纯氧、富氧增氧。虽然机械式增氧机目前基本上能满足国内要求，但是考虑到大规模正规的工厂化养鱼厂及发展趋势，纯氧、富氧增氧技术在国内的运用是必然。
对虾如果感染桃拉病毒将会不摄食；游泳无力、反应迟钝；甲壳变软，虾体变红，尤其是尾扇变红，所以该病又称为红尾病。感染桃拉病毒有急性期和慢性期（恢复期）两种病程，急性感染常发生在幼虾期，会发生养殖虾群大量死亡，死亡率高达90%。残存的虾会转为慢性感染，成虾多为慢性感染，死亡率通常小于50%，其次，外壳有多处坏死区域。